1. 병인치료에 가장 이상적인 치료법은 수면 무호흡증의 원인을 제거하고 신장을 유지하는 것이다. 수술 방법은 병의 본질에 달려 있다. 선천성 신장수뇨관 연결부가 좁으면 신장성형술을 사용할 수 있고, 신장, 수뇨관 결석은 자갈이나 석술로 치료할 수 있다. 이 수술들은 최근 몇 년 동안 내시경을 통해 진행될 수 있다. 수술 후 수면 무호흡증과 신장 기능이 개선될 것이다.
2. 신장조구상태가 위급하거나 고인 신장병의 원인이 제거되지 않은 경우 먼저 경색 위에 배류하고 감염이 통제될 때까지 기다린 후 원인을 제거하는 수술을 해야 한다. 폐쇄의 원인이 풀릴 수 없을 때 신장조구술은 영구적인 치료로 쓰인다.
3. 신장절제술에 고인 신장이 심하고, 남은 신장이 실질적으로 너무 적거나, 심각한 감염, 즉 신장성 농흉을 동반하며, 반대쪽 신장 기능이 좋으면 병변 신장을 제거할 수 있다.